请假一天扣三天工资不合法。依据《劳动法》，用人单位不得无故克扣员工工资，只能不支付请假期间工资。若实施此规定，可能导致员工权益受损，引发劳动争议，甚至面临法律诉讼。
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对此类情况，员工可选择投诉或申请仲裁。建议先与用人单位沟通，若协商无果，可向当地劳动部门投诉或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以维护自身合法权益。
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不合法。处理方式：1.与用人单位沟通，明确表达不满，要求改正；2.若沟通无果，收集证据，如工资条、请假记录等；3.向当地劳动部门投诉，或申请劳动争议仲裁；4.对仲裁结果不服，可依法向法院提起诉讼。